Bölüm 1
/Başlangıç
Yayın Tarihi: 08 Kasım 1998
Mulder'ın uzaylıların varlığına ve bir devlet sırrına dair iddiaları bir teftiş kurulu tarafından araştırılırken, ajanlar ölümcül bir uzaylının izini sürerler.
Bölüm 2
/Sürüş
Yayın Tarihi: 15 Kasım 1998
Kafasının patlamasını engellemek için sürekli hareket hâlinde olması gereken bir adam Mulder'ı kaçırır ve Los Angeles'a götürür.
Bölüm 3
/Üçgen
Yayın Tarihi: 22 Kasım 1998
Mulder bir hayalet gemiyle 1939'a gider ve Nazilerin bir nükleer bilim adamını öldürmelerine engel olmaya çalışır.
Bölüm 4
/Rüyalar Diyarı
Yayın Tarihi: 29 Kasım 1998
Meşhur 51. Bölge'de meydana gelen garip bir olay, Mulder'ın bilincini bir yabancınınkiyle değiştirir.
Bölüm 5
/-Rüyalar Diyarı II
Yayın Tarihi: 06 Aralık 1998
"Beden Değiştirme" bölümünün İkinci Kısmı.
Bölüm 6
/Hayalet Noel'i Nasıl Çaldı
Yayın Tarihi: 13 Aralık 1998
Mulder ve Scully, Noel Arifesi'nde perili bir evi soruşturur.
Bölüm 7
/Sevginin Şartları
Yayın Tarihi: 03 Ocak 1999
"Rosemary'nin Bebeği." Bir iblisin kadınları hamile bırakarak kendisiyle aynı görünüşe sahip çocuklar yaratma hikâyesini anlatır.
Bölüm 8
/Yağmur Kralı
Yayın Tarihi: 10 Ocak 1999
Sevgililer Günü bölümü: Meteoroloji Adam'ın duyguları hava durumunu kontrol eder.
Bölüm 9
/S.R. 819
Yayın Tarihi: 17 Ocak 1999
Skinner, hayatına 24 saat içinde son verecek gizemli bir hastalığa yakalandığında Mulder ve Scully bazı cevaplar arar.
Bölüm 10
/Tithonus
Yayın Tarihi: 24 Ocak 1999
Scully, görünürde diğer insanların ölümünü önceden tahmin edebilen bir fotoğrafçıyı takip eder.
Bölüm 11
/İki Baba
Yayın Tarihi: 07 Şubat 1999
Mitoloji bölümü (Birinci Kısım) Cassandra ve uzaylı asilerinin dönüşünü ve Tom ile Bill Mulder'ın bakış açısından uzaylı istilasını anlatıyor.
Bölüm 12
/Bir Oğul
Yayın Tarihi: 14 Şubat 1999
İkinci Kısım uzaylı melez planına ve Mulder'ın kız kardeşinin kaybolmasına açıklık getirir.
Bölüm 13
/Tehlikeli Sular
Yayın Tarihi: 21 Şubat 1999
Florida sahillerine bir kasırga vurduğunda Arthur Dales, bir çiftin ve oğullarının kaybolmasından bir deniz canavarını sorumlu tutar ve ajanlar soruşturmaya gider.
Bölüm 14
/Pazartesi
Yayın Tarihi: 28 Şubat 1999
Mulder ve Scully Bugün Aslında Dündü filmindeki gibi bir banka soygununu defalarca yeniden yaşarlar. Ta ki Mulder, de ja vu yaşadığını anlayana kadar.
Bölüm 15
/Kırsal
Yayın Tarihi: 07 Mart 1999
Mulder ve Scully, sessizlik yemini edilen bir topluluktaki bir dizi gizemli ölümü soruşturmak için gizli göreve gider.
Bölüm 16
/Alfa
Yayın Tarihi: 28 Mart 1999
Ajanlar, birkaç kişiyi öldürdüğünden şüphelenilen efsanevi bir vahşi köpeği avlar.
Bölüm 17
/Trevor
Yayın Tarihi: 11 Nisan 1999
Bir hortuma yakalanan bir mahkûmun bedeni değişime uğrar, böylece nesnelerin içinden geçebilmeye başlar ve evlatlık oğlunu aramaya başlar.
Bölüm 18
/Milagro
Yayın Tarihi: 18 Nisan 1999
Mulder'ın yazar komşusu, hayal gücünü kullanarak ikinci kişiliğini ortaya çıkarır ve önce sevgilileri öldürür sonra da arzularının odak noktası olan Scully'yi hedef alır.
Bölüm 19
/Doğal Olmayan
Yayın Tarihi: 25 Nisan 1999
Arthur Dales'in kardeşi, 1940'larda New Mexico, Roswell'deki bir Afroamerikan beyzbol takımında gizlenen yetenekli bir uzaylı beyzbolcunun hikâyesini anlatır.
Bölüm 20
/Üç Benzer
Yayın Tarihi: 02 Mayıs 1999
Yalnız Silahşorlar, Las Vegas'taki bir güvenlik yüklenicileri konferansına sızarken Susanne Modeski'yle karşılaşırlar.
Bölüm 21
/Saha Gezisi
Yayın Tarihi: 09 Mayıs 1999
Mulder ve Scully ölü bir çifti soruştururken zihin etkileyen yerel bir mantar türü bulurlar.
Bölüm 22
/Biyolojik Oluşum
Yayın Tarihi: 16 Mayıs 1999
Mulder, Afrika'da keşfedilen metal nesnelerin, yaşamın evrenin başka bir yerinde başladığının kanıtı olduğuna inanır.